安放红外光谱仪的仪器间和操作间应安装空调，仪器间的温度应控制在17~27℃。仪器红外光谱仪内如果有电源变压器，会产生热量，光源和电路板也是发热元器件，所以，仪器内部的温度比仪器间的温度要高出好几度。如果仪器间温度太高，那么，仪器就不能正常工作。冬天仪器间温度太低时，仪器也不能正常工作。
仪器间和操作间的相对湿度好维持在50%左右。室内的湿度是很难控制的，一般的实验室没有控制湿度的条件，在我国北方，冬天的室内相对湿度会下降到20%左右，夏天会上升到90%左右。在南方，全年室内相对湿度通常都会高于50%。安装空调机后，夏天能除去室内的一部分水汽，但很难将室内相对湿度降到50%左右。夏天湿度太高时，有条件的应在仪器间安放一部除湿器。湿度太低，容易产生静电；湿度太高，仪器的零部件容易损坏。

仪器间的窗户好安装双层玻璃。双层玻璃能有效防止室外的灰尘进入室内。平时，仪器间的窗户应该关严，若需要通风，也应尽快将窗户关上。有条件的实验室应将过滤后的空气送入室内。在北方，春天沙尘暴较多，空气中的沙尘颗粒浓度较大，应关好门窗，注意防尘。

地面不宜铺地毯，若要铺地毯就应铺防静电的地毯。普通化纤地毯在冬天相对湿度低时容易产生静电。静电也有可能损坏仪器。
红外仪器间应与化学实验室分开。因为化学实验室过程产生的气体和从试剂瓶中挥发出来的气体会腐蚀仪器的零部件，使仪器的寿命缩短。分束器上透He-Ne激光的半透膜镀层和MCT检测器的窗口材料都是ZnSe。ZnSe对卤化物气体非常敏感，因此要防止卤化物气体进入红外光谱仪。
安放红外仪器的实验台或实验桌应结实、牢靠，台面或桌面的厚度不能太薄，以防止因仪器长期放置产生变形弯曲。当红外仪器主机与红外显微镜附件、拉曼光谱附件、色谱-红外接口附件、热重-红外接口附件等链接时，要求台面或桌面的厚度更厚些，以防止应台面或桌面弯曲而导致光路偏离原来的方向，使达到检测器的信号减弱，或使检测器检测不到信号，影响仪器的正常工作。
仪器的后面应留一定的空间，距离墙壁有0.5m以上，给仪器的维修工程师留有足够的工作空间。

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